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Para efetuar medidas de investigação epidemiológica é importante a notificação compulsória de algumas doenças. O Ministério da Saúde estabelece que, em todo território nacional, devem ser notificadas, dentre outras, as seguintes doenças:
sífilis congênita, varíola e hepatite A.
hanseníase, esquistossomose e sarampo.
varicela, sarampo e meningite.
encefalite, dengue e escabiose.
malária, escarlatina e gonorréia.