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A análise observacional de dados de prontuários que demonstra uma associação positiva entre o uso de um novo fármaco e um desfecho adverso, quando comparado a uma terapia padrão, pode estar fundamentalmente comprometida pelo viés de confusão por indicação, no qual a própria condição clínica que motiva a prescrição do novo tratamento é o fator que verdadeiramente eleva o risco do desfecho. Essa análise valida-se em:
tal cenário descreve um viés de seleção, no qual os grupos de tratamento são incomparáveis desde o início, mas não um viés de confusão
tem-se descrito o viés de confusão por indicação, um tipo específico de fator de confusão em que a gravidade da doença ou o prognóstico do paciente influencia a escolha terapêutica e, simultaneamente, o resultado em saúde
a única forma de uma associação entre fármaco e desfecho ser comprometida é pelo viés de aferição, relacionado a erros na medição da exposição ou do resultado
está sendo descrito um caso de modificação de efeito, no qual o novo fármaco tem um efeito biológico diferente em pacientes mais graves, não se tratando de um viés


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