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Embora a propagação por sementes na produção de mudas de fruteiras tenha sido muito usada no passado, atualmente seu uso se restringe, em espécies comerciais como os citros, abacateiro, caju e mangueira, quase que, exclusivamente, para a obtenção de:
Variedade de copas com baixa heterozigose.
Variedade de porta-enxertos.
Variedade de copas com alta heterozigose.
Variedade de copas com alta juvenilidade.