Espécies vegetais perenes podem ser cultivadas comercialmente na forma de clones, obtidos por reprodução vegetativa. Como exemplo pode-se citar inúmeras fruteiras, plantas ornamentais, seringueira, eucalipto. Sobre o uso dos clones, pode-se afirmar que:
a única vantagem do uso de clones é a maior precocidade da produção.
sementes obtidas do cruzamento de indivíduos de um mesmo clone equivalem a sementes híbridas.
a uniformidade dos clones não traz problemas de vulnerabilidade genética, pois os clones são sempre escolhidos entre os indivíduos mais heterozigotos e, portanto, mais vigorosos.
a clonagem de plantas em grandes culturas anuais, para fins comerciais, não é recomendada devido ao maior custo e maior complexidade das operações envolvidas no plantio de mudas, quando comparadas ao plantio por sementes.
aumenta a variabilidade genética já que aumenta a heterozigose.