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Algumas tecnologias são empregadas para a remoção de compostos nitrogenados presentes em águas residuárias, que se baseiam em rotas biológicas alternativas para oxidação da amônia e conversão a nitrogênio gasoso. Há um processo que é uma alternativa para a etapa de nitrificação biológica, no qual ocorre a nitrificação parcial da amônia a nitrito para posterior desnitrificação, possibilitando a redução da quantidade de oxigênio dissolvido necessária para o processo de nitrificação e da quantidade de doadores de elétrons necessária para o processo de desnitrificação. Tal processo é mais indicado em efluente com alta concentração de nitrogênio amoniacal. Trata-se do processo conhecido como:
Anammox
Sharon
SND
Kraft