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Com base no reator anaeróbio de fluxo ascendente, cada floco biológico formado pode ser considerado uma estação de tratamento, pois abriga microrganismos especializados na decomposição completa da matéria orgânica. A decomposição pode ser categorizada em linhas gerais, assim como a seguinte sucessão de decomposições, somente:
Matéria orgânica complexa → menor complexidade → ácidos orgânicos de maior complexidade → ácidos orgânicos de menor complexidade.
Ácidos orgânicos de menor complexidade → ácido acético → metano.
Matéria orgânica complexa → menor complexidade → ácidos orgânicos de maior complexidade → ácidos orgânicos de menor complexidade → ácido acético → metano.
Matéria orgânica complexa → menor complexidade → ácido acético → metano.
Ácidos orgânicos de maior complexidade → ácidos orgânicos de menor complexidade → ácido acético → metano.