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A mineração de carvão mineral, que contêm minerais sulfetados como pirita (FeS2) e arsenopirita (FeSAs), pode expor à atmosfera os sulfetos confinados no subsolo. Por sua vez, a exposição dos sulfetos com a água e o ar resultam em produção de chuva ácida, contaminação do solo com metais pesados, acidificação excessiva do solo e da água. Os eventos de poluição ambiental provocados pelos ciclos biogeoquímicos nas áreas de mineração de carvão mineral são explicados pela:
Metanogênese de bactérias do grupo Thiobacillus.
Redução de dióxido de carbono por bactérias do grupo Gloeobacter.
Fixação biológica de sulfetos por bactérias do grupo Desulfovibrio.
Oxidação dos sulfetos por bactérias do grupo Thiobacillus.