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Por ser a autodepuração um processo que se desenvolve ao longo do tempo e considerando-se a dimensão do curso d´água receptor como predominantemente longitudinal, tem-se que os estágios da sucessão ecológica podem ser associados a zonas fisicamente identificáveis no rio. A fase em que a qualidade da água do corpo hídrico apresenta-se em seu estado mais deteriorado, havendo intensa atividade dos microrganismos decompositores, é a
Zona de águas limpas.
Zona de degradação.
Zona de recuperação.
Zona de águas turvas.
Zona de decomposição ativa.