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Uma das etapas mais importante no ciclo da assistência farmacêutica é a seleção de medicamentos. Dentre os critérios que devem ser adotados por uma comissão de farmácia e terapêutica, deve ser que a escolha dos medicamentos se paute na:
decisão soberana da comissão de controle de infecção hospitalar na seleção de antimicrobianos
priorização de inclusão de medicamentos com associações fixas de princípios ativos
padronização pelo nome do princípio ativo adotando a denominação comum brasileira
priorização da melhor comodidade posológica em detrimento da menor toxicidade relativa