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Staphylococcus epidermidis pode ser isolado em meios de cultura comuns, tais como o ágar tripticase soja, o ágar de infuso de coração e cérebro e o ágar sangue. A diferenciação inicial entre S. epidermidis e S. aureus é feita pelas características culturais e morfológicas das duas espécies e, principalmente:
Pela sensibilidade aos antimicrobianos cloranfenicol e tetraciclina.
Pelo teste da coagulase.
Pela pesquisa do antígeno B.
Pelo teste de susceptibilidade à optoquina e o de bile-solubilidade.
Pela detecção da toxina no soro.