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O Conselho Federal de Fonoaudiologia publicou, em 2007, o “Manual de Biossegurança sobre Medidas de Controle de Infecção para Fonoaudiólogos”. O manual define Biossegurança, como o conjunto de ações voltadas para a prevenção, minimização ou eliminação de riscos à saúde do profissional, de seus clientes e do meio ambiente. Os profissionais estão expostos a vários riscos ocupacionais, entre eles, os riscos físicos, químicos, biológicos, ergonômicos e de acidentes. Alguns estudos destacam especialmente os riscos biológicos. No momento da fonoterapia, há exposição a micro-organismos presente na saliva, sangue e nas mucosas oral, nasal e auditiva. A análise feita na literatura demonstra que as infecções mais comuns na manipulação oral são:
infecções bacterianas, infecções virais e infecções fúngicas;
infecções virais e infecções fúngicas;
infecções bacterianas e infecções virais;
apenas infecções bacterianas.