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A enteroscopia por cápsula está contraindicada para Investigação de
anemia ferropriva em paciente masculino que faz uso frequente de medicamentos anti-inflamatórios não esteroides, e tem endoscopia digestiva alta e colonoscopia normais.
episódios repetidos de melena, sem repercussão hemodinâmica no último mês, em paciente com endoscopia digestiva alta e colonoscopia normais.
episódio de enterorragia de vulto, com hipotensão de início há 24 horas, em paciente com endoscopia digestiva alta e colonoscopia normais.
dor abdominal em paciente com Doença de Crohn de delgado com estenoses à enterografia por ressonância magnética e quadros suboclusivos.
doença celíaca refratária.