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O esôfago de Barret é uma condição adquirida que resulta do refluxo gastroesofágico crônico, sendo incluída na sua fisiopatogenia fatores associados como:
depuração ácida esofágica excessiva
tensão transitória do esfíncter inferior do esôfago
maior dano pelo tempo prolongado de exposição ao pH ácido
piora da metaplasia devido ao número de episódios de refluxo