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Constitui indicação clássica de ecocardiografia transesofágica, segundo a Sociedade Brasileira de Cardiologia:
Suspeita clínica de Endocardite Infecciosa e ecocardiograma transtorácico não diagnóstico.
Avaliação de valvopatia pulmonar.
Paciente idoso internado por AVC.
Rastreamento ecocardiográfico em pacientes com suspeita de cardiomiopatia hipertrófica.