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A periodontite é considerada uma doença infecciosa multifatorial, na qual as bactérias têm papel central. Os principais agentes patógenos periodontais relacionados com o tipo grave de periodontite são:
Aggregatibacter actinomycetemcomitans e Porphyromonas gingivalis, que ocorrem em cerca de 40 a 50% dos casos.
as bactérias Psittacula intermedia e Porphyromonas gingivalis, presentes em 100% dos casos com bolsa periodontal.
os agentes subgengivais Fusobacterium nucleatum e Actinobacillus actinomycetemcomitans, que estão presentes em 100% dos casos.
as micobactérias e Helicobacter pylori, presentes nos casos de periodontite agressiva juvenil.
os micro-organismos Candida albicans e Histoplasma capsulatum, presentes em 60% dos casos relacionados com a Síndrome de Sjögren.