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Embora até o momento não tenha sido possível definir o papel de um micro-organismo específico das alterações perirradiculares, evidências sugerem um grupo de espécies bacterianas envolvidas nos diferentes tipos de infecção.
Dentre as de maior percentual de incidência, podem-se citar:
prevotella denticola, eubacterium nadatum e streptococcus.
fusubacterium nucleatum, prevotella oralis e eubacterium nadatum.
veillonela parvulla, bacteroides e actinomyces.
fusobacterium nucleatum, streptococcus sp e bacteroides sp.