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Na fase de obturação do sistema de canais radiculares, necessitamos utilizar métodos químicos para realizar a desinfecção dos cones de guta-percha. O protocolo utilizado é:
Imersão em solução de germicida por 1 minuto.
Imersão em solução de glicerina fenicada por 3 minutos.
Imersão em solução de clorexidina a 2% por 1 minuto.
Imersão em solução de hipoclorito de sódio a 2,5% por 1 minuto.