Os problemas perioendodônticos podem originar-se de lesões periodontais ou endodônticas de forma primária ou constituírem-se lesões combinadas verdadeiras. Para o seu diagnóstico diferencial deve-se observar que
a dor proveniente de lesões endodônticas é geralmente controlada por analgésicos potentes, enquanto a de lesões periodontais não.
edemas que ocorrem no fundo de saco ou espalhados pelos planos faciais são característicos de lesões periodontais primárias.
as radiografias periapicais podem determinar a origem da lesão perioendodôntica.
a lesão de origem periodontal primária responde positivamente ao teste de vitalidade pulpar pelo calor.
nas lesões combinadas, os testes pulpares dão resultados positivos e o dente terá profundidade de sondagem em vários locais.