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As diversas linhagens de camundongos podem ser classificadas de acordo com o seu grau de definição genética. É correto afirmar que linhagens:
congênicas resultam da transferência de um pedaço de um cromossomo, uma mutação ou gene (alelo) do fundo genético de uma linhagem doadora a uma linhagem receptora “inbred” através do intercruzamento (IxI).
co-isogênicas são linhagens isogênicas que sofreram mutação espontânea.
recombinantes isogênicas resultam do cruzamento de duas linhagens isogênicas, e seus híbridos são mantidos acasalados por I x I por 20 gerações sucessivas.
transgênicas são obtidas pela ação do etil nitroso ureia (ENU) sobre células, e em seguida a célula é introduzida no zigoto.
knockout–portadora de um gene modificado por uma ou mais mutações substituiu o gene funcional original, e isso leva à expressão de uma proteína alterada na nova linhagem de animal transgênico.