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Para manter a qualidade genética de uma linhagem isogênica, o núcleo fundador deve ser formado por um número reduzido de casais monogâmicos. Este procedimento tem por objetivo:
reduzir o uso de animais no experimento.
reduzir o canibalismo da colônia.
identificar a ocorrência de mutações.
economizar espaço na colônia.
diminuir a ocorrência de enfermidades.