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Os programas sanitários são elaborados com o objetivo de:
Demonstrar a ausência de doença ou infecção, determinar a presença ou a distribuição de doenças ou infecções, e de detectar doenças não emergentes o mais cedo possível.
Controlar ou erradicar doenças de grande impacto econômico na saúde animal e, também, na saúde humana.
Auxiliar médicos veterinários e agentes sanitários sobre quais as medidas adotadas por alguns veterinários para o controle dos focos e posteriormente disseminação das doenças.
Demonstrar a presença de doença ou infecção, erradicar a presença ou a distribuição de doenças ou infecções, e de detectar doenças não emergentes o mais cedo possível.
Para o estabelecimento de cada uma das enfermidades alvo, independente da frequência da doença na população.