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Para a escolha do antimicrobiano, devem‐se considerar:
custos do tratamento, valor do animal para o proprietário, persistência do agente, barreiras para eliminação e os custos dos resíduos de antimicrobianos na produção animal.
toxicidade para o hospedeiro, interações medicamentosas, destruição da microbiota tecidual no local da administração, resíduos em animais produtores de alimentos, promoção de resistência bacteriana e interferência nos mecanismos de defesa do animal
condições do paciente e do médico veterinário de forma a evitar a resistência bacteriana adquirida por mutações e persistência de processos infecciosos encistados.
via de administração, propriedades de teratogenicidade, mutagenicidade, inflamabilidade e resistência natural antimicrobiana que perturba a terapêutica instituída.
volume de distribuição, meia‐vida, taxa de depuração, atividades concentração‐independente e tempoindependente, efeito pós‐antibiótico e resistência adquirida por genes presentes no meio tecidual.