A organização funcional traz algumas vantagens, EXCETO:
Proporciona o máximo de especialização nos diversos órgãos ou cargos da organização.
Permite a melhor supervisão técnica possível, com a especialização em todos os níveis.
Desenvolve comunicações diretas, sem intermediação, mais rápidas e menos sujeitas a distorções de transmissão.
Diluição e consequente perda de autoridade de comando.
Separa as funções de planejamento e de controle das funções de execução.