As auditorias operacionais têm como principal objetivo:

vigiar a produção e a produtividade e avaliar os resultados alcançados diante de objetivos e metas fixados para um determinado período;

vigiar as transações sob as óticas da economicidade, eficiência e eficácia e das causas e dos efeitos decorrentes;

identificar desvios relevantes e apontar atividades e departamentos fora do padrão de desempenho esperado;

fiscalizar as transações sob as óticas financeira e patrimonial, bem como os registros delas decorrentes;

certificar a adequação dos controles internos e apontar irregularidades e fraudes detectados.