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A determinação da identificação de um organismo é um processo composto por algumas fases. Dentre os métodos de análises empregados, o método de coloração de Gram é um dos mais importantes métodos de coloração diferencial em análises clínicas. Nesse método:
as bactérias gram-negativas possuem parede celular formada principalmente por lipídeos que durante a coloração de Gram não são solubilizados pela aplicação de solvente orgânico, descarando as células
as bactérias gram-positivas não são afetadas pela aplicação de solventes orgânicos, logo o complexo violeta iodo não é perdido, e a coloração observada é violeta (azul intenso)
as bactérias gram-positivas são coradas com safranina
as bactérias gram-negativas apresentam coloração violeta (azul intenso) após a etapa de aplicação do solvente orgânico