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Montagens de genomas bacterianos, a partir de dados de NGS...
Montagens de genomas bacterianos, a partir de dados de NGS (Next Generation Sequencing), podem ser realizadas por duas principais abordagens: de novo ou mapeamento por referência. Abaixo são apresentadas possíveis etapas de um pipeline para montagem de um genoma bacteriano, a partir de sequências provenientes de um sequenciamento em uma plataforma NGS. Sobre esse tema, assinale a afirmativa correta.
A
Montagem do genoma com abordagem de novo tem a seguinte ordem de execução no seu pipeline: análise de qualidade, trimagem, ordenamento, montagem, alinhamento e fechamento de gaps.
B
Montagem do genoma com abordagem de novo tem a seguinte ordem de execução no seu pipeline: análise de qualidade, trimagem, alinhamento, montagem, ordenamento e fechamento de gaps.
C
Montagem do genoma com abordagem de mapeamento por referência tem, no seu pipeline, após a escolha e a montagem da sequência referência, na ordem de execução: análise de qualidade, alinhamento na referência e ordenamento.
D
Montagem do genoma com abordagem de mapeamento por referência tem, no seu pipeline, após a escolha da sequência referência, na ordem de execução: análise de qualidade, trimagem, alinhamento de novo na referência, fechamento de gaps e ordenamento.
E
Montagem do genoma com abordagem de mapeamento por referência tem, no seu pipeline, após a escolha e a montagem da sequência referência, na ordem de execução: análise de qualidade, trimagem, alinhamento na referência e compactação dos grafos e visualização da montagem.