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Comparando Northern blot, RT-qPCR e RNA-seq, considere alcance global, limite de detecção e resolução estrutural (isoformas/splicing). Com base em Alberts et al., 2022; Mortazavi et al., 2008; Bustin et al., MIQE, qual proposição é rigorosamente correta?
RNA-seq mede padrões locais mas não discrimina splicing alternativo, já que os reads curtos não cobrem junções de exons com fidelidade robusta.
Northern supera RT-qPCR em sensibilidade para baixa abundância, dispensando amplificação, e fornece quantificação absoluta sem padrões externos.
RNA-seq limita-se a genes anotados, não detectando transcritos novos ou junções exóticas, devido ao viés de mapeamento ao genoma de referência.
RT-qPCR quantifica globalmente sem primers direcionados, pois o melting curve distingue todos os transcritos por picos térmicos específicos universais.
RT-qPCR requer síntese de cDNA e quantifica transcritos específicos com alta sensibilidade, mas não recupera isoformas globais sem primers/sondas desenhados a priori.