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A higiene dos alimentos consiste, na adoção de medidas preventivas e de controle para a remoção de agentes causadores de doenças, com o objetivo de conferir proteção específica contra as doenças transmitidas por alimentos, proporcionando condições adequadas para a produção e o consumo higiênico dos mesmos. As doenças transmitidas por alimentos podem, geralmente, ser causadas pelos seguintes agentes:
Bacterianos: Salmonella sp, Escherichia coli, Shigella sp, Listeria monocytogenes, Vibrio cholerae.
Protozoários: Amanita muscarina ou Agaricus muscaria, adenovírus, spergillus flavus com aflatoxina, Amanita phalloides.
Toxinas das seguintes bactérias: Taenia solium e saginata,Trichinella spiralis, Entamoeba histolytica, Giardia lambia, Cryptosporidium, Toxoplasma gondii.
Helmintos: Bacillus cereus, Staphilococcus aureus, Clostridium botulinum.