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No controle da infecção hospitalar, o gluconato de clorexidina é usado por possuir:
Uma boa atividade contra o vírus da AIDS.
Uma efetiva ação sobre germes em geral.
Ação efetiva contra o bacilo da tuberculose.
Uma boa atividade contra bactérias gram-positivas.
Ação no aumento do crescimento de bactérias e fungos.