Em relação as competências da direção nacional do Sistema...

Identificar estabelecimentos hospitalares de referência e gerir sistemas públicos de alta complexidade.

Gerir laboratórios públicos de saúde e hemocentros

Controlar e fiscalizar procedimentos, produtos e substâncias de interesse para a saúde.

Promover a centralização dos serviços e ações de saúde das Unidades Federadas e dos Municípios.