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O efeito de autodepuração de um ambiente natural é a capacidade que este ambiente tem de se recuperar por vias próprias ao seu estado original, após uma perturbação, ou melhor, o lançamento de um poluente.
Portanto, quando um esgoto doméstico é lançado em um rio:
Os peixes morrem por intoxicação.
Os peixes e outros organismos aquáticos, como as algas, consomem as bactérias e reaeram o sistema.
A concentração de microrganismos cresce à medida que a matéria orgânica vai sendo consumida.
O oxigênio dissolvido da água é consumido pelos microrganismos até que não haja mais condições de vida no rio, não havendo mais como recuperá-lo.
A capacidade que um ambiente natural tem de se recuperar por vias próprias é inesgotável; só depende do tempo.