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A autodepuração é um processo que se desenvolve ao longo do tempo e, considerando-se a dimensão do curso d’água receptor como predominantemente longitudinal, tem-se que os estágios da sucessão ecológica podem ser associados às zonas fisicamente identificáveis no rio. Sobre as principais zonas de autodepuração, é correto afirmar que
na zona de degradação há um aumento nos teores de gás carbônico provocando uma queda no pH da água, tornando-a mais ácida.
na zona de decomposição ativa ocorre uma fertilização do meio, pois a amônia é convertida a nitritos e nitratos, e os compostos de fósforo são transformados em fosfatos.
na zona de recuperação, os compostos nitrogenados complexos apresentam-se ainda em altos teores, embora já ocorra a conversão de grande parte em amônia.
na zona de águas poluídas, o oxigênio dissolvido atinge sua menor concentração e o nitrogênio apresenta-se ainda na forma orgânica.
na zona de águas limpas, a taxa de consumo de matéria orgânica atinge o seu máximo, implicando a taxa máxima de consumo de oxigênio dissolvido.