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As principais pragas e doenças que atacam os viveiros florestais estão associadas principalmente a fatores como disponibilidade de água, sombreamento, substrato, material propagativo, sistema de produção (viveiro suspenso ou não) e tipo de manejo do viveiro (mudas malnutridas, sistema radicular). Podem ser mencionados como principais insetos-pragas que atacam os viveiros florestais os itens a seguir, exceto os da alternativa:
Cochonilha( coccus viridis), mosca-branca (bemisia tabaci), mosca-mimadora(lirimyza spp).
Pulgão (schizaphis graminum), vespa-da-galha ( leptocybe invasa), saúvas (Atta spp.).
Joaninha (Cryptolaemus montrouzieri), vespa (Telenomus remus), besouro Atopozelus opsimus.
Besouro (Monochamus galloprovincialis), grilo (Gryllus assimilis), lagarta-parda Thyrinteina arnobia.