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As alterações nos medicamentos podem ser provocadas por influência do meio ambiente, tais como a temperatura, a umidade e os gases que compõem o próprio ar; outras relacionadas às interações que podem ocorrer entre os fármacos com excipientes e/ou adjuvantes; ou ainda por fatores como o pH do meio, a qualidade dos recipientes, a presença de impurezas, etc. Podem ser citados como os processos mais frequentes:
Polimerização, inversão, tautomerização e esterificação
Dimerização, metilação, acilação e decomposição
Hidrólise, oxidação-redução, fotólise e racemização
Isomerização, saponificação, conjugação e hidrólise