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A lesão dos gânglios da base está associada à doença de Parkinson. Os gânglios da base são formados por cinco núcleos: caudado, putâmen, globo pálido, substância negra e subtalâmico. As estruturas eferentes que formam os gânglios da base são:
Porção interna do globo pálido e parte reticular da Substância Negra
Putâmen e Globo Pálido
Substância Negra e Caudado
Tálamo e Subtalâmico
Caudado e Putâmen