As atividades do SUASA, de acordo com o Decreto 5.741, de 30 de março de 2006, são executadas por 3 instâncias. São elas:
Federal; Estadual; Municipal.
Local; Mediana; Maior.
SIM; SIE; SIF.
Local; Intermediária; Central e Superior.
Manaus; Amazonas; Brasil.
