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Defeitos cardíacos complexos são responsáveis pela maioria das mortes associadas à atresia de esôfago. Os defeitos cardíacos mais comumente associados à atresia de esôfago (AE) são:
comunicação interatrial (CIA), comunicação interventricular (CIV) e tetralogia de Fallot
comunicação interatrial (CIA), persistência do canal arterial (PCA) e tetralogia de Fallot
comunicação interventricular (CIV), persistência do canal arterial (PCA) e tetralogia de Fallot
comunicação interatrial (CIA), comunicação interventricular (CIV) e persistência do canal arterial (PCA)