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Excluídas as uretrites de origem gonocócica, os demais agentes mais frequentemente encontrados nas uretrites são:
Chlamydia trachomatis, Ureaplasma urealyticum e Mycoplasma hominis.
Escherichia coli, Trichomonas vaginalis e Cândida albicans.
Protheus miriabilis, Clostridium sp e Pseudomonas aeruginosa.
Estafilococos aureus, Estreptococos epidermidis e Enterococcus.
Clostridium e Haemophilus influenza.