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A operação de Jatene pode ser realizada na seguinte cardiopatia:
discordância átrio-ventricular com discordância ventrículo-arterial.
dupla via da saída de ventrículo direito com comunicação interventricular não relacionada.
dupla via de saída de ventrículo direito com comunicação interventricular subaórtica.
dupla via de entrada do ventrículo esquerdo.
dupla via de saída de ventrículo direito com comunicação interventricular subpulmonar.