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Os principais diagnósticos diferenciais clínico-laboratoriais da icterícia associada ao leite materno são:
hipotireoidismo e doença de Criggler-Najar tipo II.
atresia de vias biliares extra-hepáticas e isoimunizacao RH.
fenilcetonúria e icterícia neonatal por incompatibilidade ABO.
hipertireoidismo e fenilcetonuria.
fibrose cística e síndrome de Alagille.