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Em relação às bases moleculares da resistência aos fármacos antituberculose de primeira linha no Teste Rápido Molecular (TRM-TB / GeneXpert MTB/RIF) e no sequenciamento genético, as mutações com substituição de aminoácidos no códon 531 (como S531L) do gene rpoB e as mutações no gene katG (especialmente no códon 315) conferem, respectivamente, resistência aos seguintes fármacos:
Pirazinamida e Etambutol.
Estreptomicina e Amicacina.
Levofloxacino e Moxifloxacino.
Rifampicina e Isoniazida.
Etionamida e Bedaquilina.