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De acordo com CONSOLARO (2014), em relação aos fatores modificadores do processo de reparo, após o tratamento endodôntico, em muitos casos a regressão de lesões periapicais crônicas não ocorre por completo devido a persistência ao redor dessas lesões de:
Cristais de colesterol
Grânulos com gelatinase
Miofibroblastos
Granulomas imunogênicos