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Para o surgimento da doença periodontal é fundamental que ocorra o desequilíbrio entre as agressões do biofilme e a resposta do hospedeiro. Esse desequilíbrio está profundamente relacionado ao acúmulo de biofilme e alterações na sua composição. A disbiose é a alteração na proporção relativa das espécies de uma comunidade associada ao desenvolvimento de doenças, como ocorre na periodontite. Corresponde ao novo ambiente formado pelas alterações ecológicas da bolsa periodontal:
As alterações ecológicas da bolsa periodontal formam um ambiente mais ácido, anaeróbio e proteolítico.
As alterações ecológicas da bolsa periodontal formam um ambiente mais alcalino, anaeróbio e proteolítico.
A periodontite é caracterizada pela abundância de bactérias na bolsa periodontal, com destaque para bactérias Gram-positivas e anaeróbias.
A alteração na composição do biofilme é acompanhada por uma diminuição na sua biomassa, o que pode potencializar a ação desse biofilme sobre o hospedeiro.
O processo inflamatório observado na doença pouco interfere no biofilme, uma vez que a inflamação periodontal está presente desde os estágios iniciais de gengivite.