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Um diretório contém tipicamente um conjunto de entradas, uma por arquivo. O sistema operacional se encarrega de gerenciar o espaço em disco, identificando diferentes formas de armazenamento de arquivos e diretórios. Quanto às implementações do gerenciamento de arquivos no disco, pode-se dizer que:
a alocação contígua mantém o espaço em disco alocado ao arquivo com uma lista de blocos avulsos, onde a primeira palavra do bloco é um ponteiro para o próximo bloco, e o restante do bloco é usado para armazenar as informações do arquivo;
a alocação indexada mantém, para cada arquivo, um índice com os ponteiros para os blocos que o compõem;
a alocação encadeada é o mais simples de todos os esquemas de alocação, onde cada arquivo é armazenado no disco como um bloco contínuo de dados;
a alocação contígua permite apenas acesso sequencial aos blocos de arquivos;
a alocação indexada é simples e fácil de implementar, mas seu principal problema é a impossibilidade de alocação de espaço livre para aumentar um arquivo.