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Um benefício do uso da API JNDI em aplicações Java é a
falta de suporte ao uso de transações, tornando a escrita do código mais fácil.
existência de um banco de dados relacional embarcado (embedded), próprio da JNDI, para dar suporte à persistência de objetos, dispensando o uso de outros servidores tais como MySQL.
conversão automática de bytecode em código de máquina nativo do processador subjacente, aumentando o desempenho da aplicação.
possibilidade de chamar funções e métodos de arquivos binários baseados na tecnologia .NET, a partir de programas Java, facilitando a integração de sistemas.
possibilidade de escrever código para acessar dados em uma ou várias máquinas, desde que os recursos estejam acessíveis a partir de um diretório JNDI.