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No que diz respeito à organização hierárquica dos diretórios, os sistemas GNU/Linux possuem um padrão rígido e específico, definido pela Filesystem Hierarquy Standard, sendo dois deles descritos a seguir.
I. É um diretório que armazena as bibliotecas essenciais e os módulos do kernel Linux, sendo que bibliotecas são conjuntos de funções e recursos utilizados por programas;
II. É um diretório que armazena informações do sistema, como spool de impressora, caixas postais, logs do sistema e cache de programas.
Esses diretórios são conhecidos, respectivamente, por:
/lib/ e /var/
/sys/ e /lib/
/bin/ e /sys/
/usr/ e /bin/
/var/ e /usr/