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Considerando o sistema gerenciador de bancos de dados MySQL (v. 8.0), o comando para reparar uma tabela, com a opção de reparar somente o arquivo de índices, é:
CLEAN TABLE <nome da tabela> ENABLE;
CHECKSUM TABLE <nome da tabela> NOK;
REPAIR TABLE <nome da tabela> QUICK;
DROP TABLE <nome da tabela> DEFAULT;
RENAME TABLE <nome da tabela> ALL;