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Os fungos causam doenças por meio de três mecanismos principais:
Excreção polissacarídica, pulsação e proteínas de deslizamento rotativo.
Respostas imunes inapropriadas, produção de toxinas e micoses.
Extrema eficiência no controle de replicação, expressão gênica e conservação dos recursos celulares.
Transformação, transdução e conjugação.