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Existem diversos mecanismos envolvidos na ocorrência de Doenças Transmitidas por Alimentos. Casos de intoxicações ocorrem por:
ingestão de micro-organismos patogênicos invasivos, como Salmonella spp
presença da toxina microbiana no alimento, como, por exemplo, Shigella spp
ingestão de toxinas formadas pela proliferação do microorganismos patogênico no alimento
capacidade de o micro-organismos penetrar nos tecidos, sendo Escherichia coli a mais conhecida