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Trabalhando com o isolamento de um gene de trigo, um pesquisador desenvolveu duas estratégias de clonagem, utilizando como sonda um gene homólogo isolado de plantas de arroz. Na primeira delas, ele utilizou como material inicial o DNA extraído de culturas de células em suspensão de trigo, resultando na obtenção do clone A. Numa segunda abordagem, ele utilizou uma preparação de RNA mensageiro das mesmas células, resultando na obtenção do clone B.
Os clones obtidos serão utilizados para a realização de três experimentos:
Experimento 1 – caracterização dos elementos que regulam a expressão tecidual do gene.
Experimento 2 – expressão do gene em bactérias para purificação da proteína codificada pelo gene isolado.
Experimento 3 – isolamento de genes de proteínas que interagem com a proteína codificada pelo gene isolado através do sistema Duplo Híbrido em leveduras.
Os clones que serão utilizados, respectivamente, para cada um dos experimentos são:
clone A, clone B e clone A;
clone B, clone B e clone A;
clone A, clone B e clone B;
clone A, clone A e clone B;
clone B, clone A e clone B.
No estudo a respeito dos lagartos, o ideal seria poder saber se os mesmos indivíduos permanecem na área queimada, mas essa informação não pode ser obtida pelo fato de não se poder marcar e recapturar lagartos como se faz com grandes mamíferos.
No processo de PCR, a adição de novos nucleotídeos na síntese da nova fita de DNA é feita por uma DNA-polimerase extraída de eucariotos.
A separação das fitas do fragmento de DNA a ser amplificado é realizada por enzimas de restrição.
Entre os diferentes ciclos, o aumento do número de moléculas de DNA ocorre em progressão aritmética.
O método de análise do dióxido de enxofre legalmente prescrito é o método da quimioluminescência.
RAPD e RFLP;
AFLP e SSR;
SSR e AFLP;
RAPD e AFLP;
RFLP e SSR.
Os vetores de clonagem que devem ser utilizados, respectivamente, para as seguintes clonagens são:
Situação 1 – Clonagem de um fragmento genômico de 200Kb
Situação 2 – Clonagem de um cDNA de 1Kb
Situação 3 – Clonagem para introdução de um gene no genoma de uma planta
cromossoma artificial de levedura, plasmídeo, vetor binário de T-DNA;
plasmídeo, cromossoma artificial de bactéria, cosmídeo;
vetor Binário de T-DNA, cromossoma artificial de levedura, vetores baseados no bacteriófago Lambda;
bacteriófago Lamba, vetor binário de T-DNA, plasmídeo;
cosmídeo, vetores baseados no bacteriófago Lamba, cromossoma artificial de leveduras.
São rotineiramente utilizadas como técnicas de purificação de macromoléculas empregadas nos protocolos de purificação em larga escala de ácidos nucleicos vegetais:
precipitação seletiva através de solubilidade diferencial e extração com solventes orgânicos;
extração com solventes orgânicos e cromatografia de peneira molecular;
precipitação seletiva através de solubilidade diferencial e eletroforese de isoeletrofocalização;
cromatografia de troca iônica e cromatografia de peneira molecular.
Para se saber a densidade de orquídeas na área de estudo, podese fazer amostragem por área ou por transectos.
Depois de vários ciclos de PCR, todas as fitas de DNA clonadas terão o mesmo comprimento.
A transformação genética de plantas efetuada pela bactéria de solo Agrobacterium tumefaciens é uma das técnicas mais utilizadas para a transferência de genes para o genoma vegetal. Além de sua utilização para aintrodução de genes de interesse agronômico, esta técnica também pode ser utilizada como uma estratégia para o isolamento e clonagem de genes vegetais, tais como a clonagem através de:
mapeamento;
seleção diferencial (screening diferencial);
bibliotecas subtrativas;
seleção com anticorpos (imuno-screening);
mutagênese insercional.
Para o funcionamento correto da técnica de PCR são necessários iniciadores que devem possuir, pelo menos, 1.000 pares de bases.
No estudo a respeito do efeito do fogo na floração de orquidáceas, os espécimes coletados devem ser prensados para a sua identificação.
Com o objetivo de analisar a qualidade e quantidade do DNA plasmidial purificado em um laboratório, um pesquisador usou a técnica de separação de DNA através de eletroforese em gel de agarose. São utilizadas para esta análise as seguintes propriedades da molécula:
estrutura em dupla hélice e carga;
teor de açúcar e tamanho;
carga negativa e tamanho molecular;
percentual de bases C e G e carga positiva;
presença de desoxiribose e estrutura em dupla hélice.
O sistema Duplo Híbrido (Two-hybrid system) é uma técnica para a identificação e isolamento de genes que vem sendo largamente utilizada para a identificação de novos genes e redes regulatórias. O desenvolvimento desta técnica se encontra baseado na:
interação antígeno-anticorpo;
interação proteína-proteína que ocorre com os fatores de transcrição;
ribonucleotídeos trifosfatados, cloreto de magnésio e formamida;
DNA polimerase, dideoxinucleotídeos trifosfatados e nucleotídeos marcados
formamida, DNA ligase e dideoxinucleotídeos trifosfatados;
cloreto de magnésio, nucleotídeos trifosfatados e ribonucleotídeos marcados
DNA polimerase, ribonucleotídeos trifosfatados marcados e DNA ligase.